Yrkesmässig profil
Projektledare med erfarenhet från läkemedelsindustrin och universitetsvärlden. Vana att leda komplex forskning med ett flertalet involverade experter, där resultaten publicerats i forskarvärldens förnämsta tidskrifter. Internationell erfarenhet med preklininska och kliniska nätverk i Europa och i USA. Kunskap inom genetik med kännedom om utveckling av in-vivo och in-vitro modeller, bioinformatik och statistik.
För en utförligare redogörelse av min yrkeserfarenhet, klicka på respektive arbetsplats!
Southern Research - projektledare
University of Alabama at Birmingham - projektledare
Uppsala Universitet - projektledare
Quiatech AB - forskare
AstraZeneca - post.doc
University of Alabama at Birmingham - projektledare
Uppsala Universitet - projektledare
Quiatech AB - forskare
AstraZeneca - post.doc
Southern Research
På Southern Research i Birmingham, Alabama, USA jobbade jag som project manager och gruppchef.
Southern Research är en kontraktsforskningsorganisation med klienter både från läkemedelsindustrin, amerikanska regeringen och universitetssfären. Jag jobbade på avdelningen för drug discovery, men även divisioner för drug development och engineering finns representerade inom företaget.
Som projektledare ansvarade jag för flera kontrakt från den amerikanska regeringen (NIH) med total budget på cirka 50 miljoner kronor. Målet med denna forskning var att utveckla biomarkörer för diagnostisering av virussjukdomar, samt att framställa modeller för test av effektivitet och toxicitet i nyutvecklade vaccin och antivirala läkemedel. Vi använde både in-vitro och in-vivo modeller för detta arbete. Vi studerade även vilka gener som upp eller nedregleras vid olika virusinfektioner. Mycket av forskningen bedrevs i biosafety nivå 3+ laboratorier enligt FDAs “good laboratory practice” riktlinjer.
Efter tre månader på SRI blev jag befodrad till gruppchef och fick personalansvar för en grupp med six forskare. Jag samordnade även arbetet som utförs av en stor grupp medarbetare inom och utanför organisationen i de projekt jag drev. Jag ansvarade för att budgetar hölls och att tidsramar inte överskreds. Jag sammanställde all rapportering till våra kunder och såg till att de regulatoriska dokument som krävdes fanns tillhanda.
University of Alabama at Birmingham (2006 -2008)
Som projektledare och chef över microarray core faciliteten på University of Alabama i Birmingham ansvarade jag för framtagandet av en genetisk plattform som möjliggör simultan analys av hela det mänskliga arvsanlaget. Detta projekt startades på Uppsala Universitet (se nedan) och avslutades senare i USA i samband med gruppens flytt till Birmingham. Jag ledde en grupp som tillsammans utvecklade tillverkningsprocesser, optimering av laborativa protokoll och tog fram matematiska algoritmer för analys. Detta team bestod av både genetiker, ingenjörer och bioinformatiker.Med denna metod kunde vi sedan bl.a. visa att enäggstvillingar inte har helt identiska arvsanlag, något som rönte stor uppmärksamhet i olika medier runt om i hela världen. Bland annat gjordes ett inslag om detta på “The Today Show”, ett av USAs populäraste morgonprogram på TV. Våra resultat beskrevs också i New York Times och Scientific American och lyftes fram som en vetenskaplig highlight av Nature Genetics Reviews. Den vetenskapliga artikeln i vilken vi beskriver dessa fynd rankas som “Exceptional” av Faculty –1000 Biology.
På University of Alabama ingick jag i fakulteten och deltog i en hel del undervisning. Jag var lärare på praktiska array kurser och på teoretiska kurser i genetik för doktorander och läkarstudenter.
Uppsala universitet (2004-2006 och 2000-2001)
Jag har tjänstgjort vid institutionen för genetik och patologi på Uppsala Universitet under två perioder. Dels som post doc (2000-2001) och dels som forskare (2004-2006).
Hösten 2004 lockade min före detta doktorandhandledare tillbaka mig till akademisk forskning. Han ville att jag skulle ta på mig projektledarrollen, och starta det genomiska mikroarrayprojekt som vi sedan flyttade med till USA. Jag ledde en grupp med tre biomedicinska analytiker som under en tremånadersperiod körde de 120 000 PCR reaktioner vi behövde för att täcka det mänskliga arvsanlaget på denna array. Jag handledde också en doktorand och koordinerade de post docs som utvecklade de protokoll som användes. Jag spenderade mycket tid att optimera de robotar som användes för arrayprintning och pipettering.
Quiatech AB (2004)
Quiatech var ett biotechföretag som utvecklade DNA amiditer för oligosyntes. Dessa amiditer möjliggjorde för snabb och effektiv rening av oligonukleotider. Jag arbetade med benchmarkingförsök av dessa oligos och vi visade att renheten är mycket viktig för oligobaserade expressionsarrayer. Quiatech hade bra produkter, men hade inte riktigt tillräckligt med startkapital för att omsätta dessa i kommersiella produkter. Jag insåg detta efter sex månader och då Uppsala Universitet lockade med ett spännande och välfinansierat microarrayprojekt bestämde jag mig för att lämna företaget. Quiatech gick omkull 2005.
AstraZeneca (2001-2004)
På AstraZeneca ansvarade jag för att sätta upp en genexpressionsplatform för att analysera genuttryck i transgena djurmodeller. Mina huvudsakliga arbetsuppgifter bestod i försöksdesign, utförande av de laborativa analyserna, statistisk analys och bioinformatisk interpretering. Jag analyserade ett antal djurmodeller och cell linjer och studerade bland annat fetma, diabetes och åderförfettning. Vi var dessutom del i ett europeiskt samarbete där vi studerade åldrandets mekanismer. Vi kunde visa att en ökad mängd mutationer i mitokondirerna hos transgena möss leder till ett snabbare åldringsförlopp. Denna studie ledde till mycket uppmärksammade resultat och publicerades i Nature. Att vår studie krönte framsidan av det numret av Nature visar att samverkansprojekt mellan näringsliv och universitet kan vara mycket framgångsrika!
Publikationslista i omvänd kronologisk ordning
McBrayer, A., Camp, J.V., Tapp, R., Yamshchikov, V., Grimes, S., Noah, D., Jonsson, C.B., Bruder, C.E., Course of Seasonal Influenza A/Brisbane/59/07 H1N1 Infection in the Ferret. Virology Journal, Accepted for publication
Bruder, C.E., Yao, S., Larson, F., Camp, J., Tapp, R., McBrayer, A., Powers, N., Valdivia Granda, W., and Jonsson, C.B., Transcriptome sequencing and development of an expression microarray platform for the domestic ferret. BMC Genomics, 2010. 11(1): p. 251.
Sandgren, J., Diaz de Stahl, T., Andersson, R., Menzel, U., Piotrowski, A., Nord, H., Backdahl, M., Kiss, N., Brauckhoff, M., Komorowski, J., Dralle, H., Hessman, O., Larsson, C., Akerstrom, G., Bruder, C., Dumanski, J., and Westin, G., Recurrent genomic alterations in benign and malignant pheochromocytomas and paragangliomas revealed by whole-genome array-CGH analysis. Endocr Relat Cancer, 2010.
Poplawski, A.B., Jankowski, M., Erickson, S.W., Diaz de Stahl, T., Partridge, E.C., Crasto, C., Guo, J., Gibson, J., Menzel, U., Bruder, C.E., Kaczmarczyk, A., Benetkiewicz, M., Andersson, R., Sandgren, J., Zegarska, B., Bala, D., Srutek, E., Allison, D.B., Piotrowski, A., Zegarski, W., and Dumanski, J.P., Frequent genetic differences between matched primary and metastatic breast cancer provide an approach to identification of biomarkers for disease progression. Eur J Hum Genet, 2010. 18(5): p. 560-8.
Enjin, A., Rabe, N., Nakanishi, S.T., Vallstedt, A., Gezelius, H., Memic, F., Lind, M., Hjalt, T., Tourtellotte, W.G., Bruder, C.E., Eichele, G., Whelan, P.J., and Kullander, K., Identification of novel spinal cholinergic genetic subtypes disclose Chodl and Pitx2 as markers for fast motor neurons and partition cells. Journal Comparative Neurology, 2010. 518 (12): p. 2284-2304.
Nord, H., Hartmann, C., Andersson, R., Menzel, U., Pfeifer, S., Piotrowski, A., Bogdan, A., Kloc, W., Sandgren, J., Olofsson, T., Hesselager, G., Blomquist, E., Komorowski, J., von Deimling, A., Bruder, C.E., Dumanski, J.P., and de Stahl, T.D., Characterization of novel and complex genomic aberrations in glioblastoma using a 32K BAC array. Neuro Oncol, 2009. 11(6): p. 803-18.
Wineinger, N.E., Kennedy, R.E., Erickson, S.W., Wojczynski, M.K., Bruder, C.E., and Tiwari, H.K., Statistical issues in the analysis of DNA Copy Number Variations. Int J Comput Biol Drug Des, 2008. 1(4): p. 368-95.
Piotrowski, A., Bruder, C.E., Andersson, R., de Stahl, T.D., Menzel, U., Sandgren, J., Poplawski, A., von Tell, D., Crasto, C., Bogdan, A., Bartoszewski, R., Bebok, Z., Krzyzanowski, M., Jankowski, Z., Partridge, E.C., Komorowski, J., and Dumanski, J.P., Somatic mosaicism for copy number variation in differentiated human tissues. Hum Mutat, 2008. 29(9): p. 1118-24.
Descartes, M., Franklin, J., de Stahl, T.D., Piotrowski, A., Bruder, C.E., Dumanski, J.P., Carroll, A.J., and Mikhail, F.M., Distal 22q11.2 microduplication encompassing the BCR gene. Am J Med Genet A, 2008. 146A(23): p. 3075-81.
de Stahl, T.D., Sandgren, J., Piotrowski, A., Nord, H., Andersson, R., Menzel, U., Bogdan, A., Thuresson, A.C., Poplawski, A., von Tell, D., Hansson, C.M., Elshafie, A.I., Elghazali, G., Imreh, S., Nordenskjold, M., Upadhyaya, M., Komorowski, J., Bruder, C.E., and Dumanski, J.P., Profiling of copy number variations (CNVs) in healthy individuals from three ethnic groups using a human genome 32 K BAC-clone-based array. Hum Mutat, 2008. 29(3): p. 398-408.
Bruder, C.E., Piotrowski, A., Gijsbers, A.A., Andersson, R., Erickson, S., de Stahl, T.D., Menzel, U., Sandgren, J., von Tell, D., Poplawski, A., Crowley, M., Crasto, C., Partridge, E.C., Tiwari, H., Allison, D.B., Komorowski, J., van Ommen, G.J., Boomsma, D.I., Pedersen, N.L., den Dunnen, J.T., Wirdefeldt, K., and Dumanski, J.P., Phenotypically concordant and discordant monozygotic twins display different DNA copy-number-variation profiles. Am J Hum Genet, 2008. 82(3): p. 763-71.
Ardesjo, B., Hansson, C.M., Bruder, C.E., Rorsman, F., Betterle, C., Dumanski, J.P., Kampe, O., and Ekwall, O., Autoantibodies to glutathione S-transferase theta 1 in patients with primary sclerosing cholangitis and other autoimmune diseases. J Autoimmun, 2008. 30(4): p. 273-82.
Andersson, R., Bruder, C.E., Piotrowski, A., Menzel, U., Nord, H., Sandgren, J., Hvidsten, T.R., Diaz de Stahl, T., Dumanski, J.P., and Komorowski, J., A segmental maximum a posteriori approach to genome-wide copy number profiling. Bioinformatics, 2008. 24(6): p. 751-8.
Mikhail, F.M., Sathienkijkanchai, A., Robin, N.H., Prucka, S., Biggerstaff, J.S., Komorowski, J., Andersson, R., Bruder, C.E., Piotrowski, A., de Stahl, T.D., Dumanski, J.P., and Carroll, A.J., Overlapping phenotype of Wolf-Hirschhorn and Beckwith-Wiedemann syndromes in a girl with der(4)t(4;11)(pter;pter). Am J Med Genet A, 2007. 143A(15): p. 1760-6.
Mikhail, F.M., Descartes, M., Piotrowski, A., Andersson, R., de Stahl, T.D., Komorowski, J., Bruder, C.E., Dumanski, J.P., and Carroll, A.J., A previously unrecognized microdeletion syndrome on chromosome 22 band q11.2 encompassing the BCR gene. Am J Med Genet A, 2007. 143A(18): p. 2178-84.
Erickson, R.P., de Stahl, T.D., Bruder, C.E., and Dumanski, J.P., A patient with 22q11.2 deletion and Opitz syndrome-like phenotype has the same deletion as velocardiofacial patients. Am J Med Genet A, 2007. 143A(24): p. 3302-8.
Mantripragada, K.K., Thuresson, A.C., Piotrowski, A., Diaz de Stahl, T., Menzel, U., Grigelionis, G., Ferner, R.E., Griffiths, S., Bolund, L., Mautner, V., Nordling, M., Legius, E., Vetrie, D., Dahl, N., Messiaen, L., Upadhyaya, M., Bruder, C.E., and Dumanski, J.P., Identification of novel deletion breakpoints bordered by segmental duplications in the NF1 locus using high resolution array-CGH. J Med Genet, 2006. 43(1): p. 28-38.
Bohlooly, Y.M., Olsson, B., Bruder, C.E., Linden, D., Sjogren, K., Bjursell, M., Egecioglu, E., Svensson, L., Brodin, P., Waterton, J.C., Isaksson, O.G., Sundler, F., Ahren, B., Ohlsson, C., Oscarsson, J., and Tornell, J., Growth hormone overexpression in the central nervous system results in hyperphagia-induced obesity associated with insulin resistance and dyslipidemia. Diabetes, 2005. 54(1): p. 51-62.
Trifunovic, A., Wredenberg, A., Falkenberg, M., Spelbrink, J.N., Rovio, A.T., Bruder, C.E., Bohlooly, Y.M., Gidlof, S., Oldfors, A., Wibom, R., Tornell, J., Jacobs, H.T., and Larsson, N.G., Premature ageing in mice expressing defective mitochondrial DNA polymerase. Nature, 2004. 429(6990): p. 417-23.
Lindmark, H., Rosengren, B., Hurt-Camejo, E., and Bruder, C.E., Gene expression profiling shows that macrophages derived from mouse embryonic stem cells is an improved in vitro model for studies of vascular disease. Exp Cell Res, 2004. 300(2): p. 335-44.
von Tell, D., Bruder, C.E., Anderson, L.V., Anvret, M., and Ahlberg, G., Refined mapping of the Welander distal myopathy region on chromosome 2p13 positions the new candidate region telomeric of the DYSF locus. Neurogenetics, 2003. 4(4): p. 173-7.
Szijan, I., Rochefort, D., Bruder, C., Surace, E., Machiavelli, G., Dalamon, V., Cotignola, J., Ferreiro, V., Campero, A., Basso, A., Dumanski, J.P., and Rouleau, G.A., NF2 tumor suppressor gene: a comprehensive and efficient detection of somatic mutations by denaturing HPLC and microarray-CGH. Neuromolecular Med, 2003. 3(1): p. 41-52.
Mantripragada, K.K., Buckley, P.G., Benetkiewicz, M., De Bustos, C., Hirvela, C., Jarbo, C., Bruder, C.E., Wensman, H., Mathiesen, T., Nyberg, G., Papi, L., Collins, V.P., Ichimura, K., Evans, G., and Dumanski, J.P., High-resolution profiling of an 11 Mb segment of human chromosome 22 in sporadic schwannoma using array-CGH. Int J Oncol, 2003. 22(3): p. 615-22.
Hansson, C.M., Ali, H., Bruder, C.E., Fransson, I., Kluge, S., Andersson, B., Roe, B.A., Menzel, U., and Dumanski, J.P., Strong conservation of the human NF2 locus based on sequence comparison in five species. Mamm Genome, 2003. 14(8): p. 526-36.
Buckley, P.G., Mantripragada, K.K., Benetkiewicz, M., Tapia-Paez, I., Diaz De Stahl, T., Rosenquist, M., Ali, H., Jarbo, C., De Bustos, C., Hirvela, C., Sinder Wilen, B., Fransson, I., Thyr, C., Johnsson, B.I., Bruder, C.E., Menzel, U., Hergersberg, M., Mandahl, N., Blennow, E., Wedell, A., Beare, D.M., Collins, J.E., Dunham, I., Albertson, D., Pinkel, D., Bastian, B.C., Faruqi, A.F., Lasken, R.S., Ichimura, K., Collins, V.P., and Dumanski, J.P., A full-coverage, high-resolution human chromosome 22 genomic microarray for clinical and research applications. Hum Mol Genet, 2002. 11(25): p. 3221-9.
Bruder, C.E., Hirvela, C., Tapia-Paez, I., Fransson, I., Segraves, R., Hamilton, G., Zhang, X.X., Evans, D.G., Wallace, A.J., Baser, M.E., Zucman-Rossi, J., Hergersberg, M., Boltshauser, E., Papi, L., Rouleau, G.A., Poptodorov, G., Jordanova, A., Rask-Andersen, H., Kluwe, L., Mautner, V., Sainio, M., Hung, G., Mathiesen, T., Moller, C., Pulst, S.M., Harder, H., Heiberg, A., Honda, M., Niimura, M., Sahlen, S., Blennow, E., Albertson, D.G., Pinkel, D., and Dumanski, J.P., High resolution deletion analysis of constitutional DNA from neurofibromatosis type 2 (NF2) patients using microarray-CGH. Hum Mol Genet, 2001. 10(3): p. 271-82.
Tapia-Paez, I., O'Brien, K.P., Kost-Alimova, M., Sahlen, S., Kedra, D., Bruder, C.E., Andersson, B., Roe, B.A., Hu, P., Imreh, S., Blennow, E., and Dumanski, J.P., Fine mapping of the constitutional translocation t(11;22)(q23;q11). Hum Genet, 2000. 106(5): p. 506-16.
Dunham, I., Shimizu, N., Roe, B.A., Chissoe, S., Hunt, A.R., Collins, J.E., Bruskiewich, R., Beare, D.M., Clamp, M., Smink, L.J., Ainscough, R., Almeida, J.P., Babbage, A., Bagguley, C., Bailey, J., Barlow, K., Bates, K.N., Beasley, O., Bird, C.P., Blakey, S., Bridgeman, A.M., Buck, D., Burgess, J., Burrill, W.D., Bruder, C.E., O'Brien, K.P., and et al., The DNA sequence of human chromosome 22. Nature, 1999. 402(6761): p. 489-95.
Bruder, C.E., Ichimura, K., Tingby, O., Hirakawa, K., Komatsuzaki, A., Tamura, A., Yuasa, Y., Collins, V.P., and Dumanski, J.P., A group of schwannomas with interstitial deletions on 22q located outside the NF2 locus shows no detectable mutations in the NF2 gene. Hum Genet, 1999. 104(5): p. 418-24.
Bruder, C.E., Ichimura, K., Blennow, E., Ikeuchi, T., Yamaguchi, T., Yuasa, Y., Collins, V.P., and Dumanski, J.P., Severe phenotype of neurofibromatosis type 2 in a patient with a 7.4-MB constitutional deletion on chromosome 22: possible localization of a neurofibromatosis type 2 modifier gene? Genes Chromosomes Cancer, 1999. 25(2): p. 184-90.
Bruder, C.E., Dumanski, J.P., and Kedra, D., The mouse ortholog of the human SMARCB1 gene encodes two splice forms. Biochem Biophys Res Commun, 1999. 257(3): p. 886-90.
Sulman, E.P., Dumanski, J.P., White, P.S., Zhao, H., Maris, J.M., Mathiesen, T., Bruder, C., Cnaan, A., and Brodeur, G.M., Identification of a consistent region of allelic loss on 1p32 in meningiomas: correlation with increased morbidity. Cancer Res, 1998. 58(15): p. 3226-30.
Carlson, K.M., Bruder, C., Nordenskjold, M., and Dumanski, J.P., 1p and 3p deletions in meningiomas without detectable aberrations of chromosome 22 identified by comparative genomic hybridization. Genes Chromosomes Cancer, 1997. 20(4): p. 419-24.
Bruder, C.E., Yao, S., Larson, F., Camp, J., Tapp, R., McBrayer, A., Powers, N., Valdivia Granda, W., and Jonsson, C.B., Transcriptome sequencing and development of an expression microarray platform for the domestic ferret. BMC Genomics, 2010. 11(1): p. 251.
Sandgren, J., Diaz de Stahl, T., Andersson, R., Menzel, U., Piotrowski, A., Nord, H., Backdahl, M., Kiss, N., Brauckhoff, M., Komorowski, J., Dralle, H., Hessman, O., Larsson, C., Akerstrom, G., Bruder, C., Dumanski, J., and Westin, G., Recurrent genomic alterations in benign and malignant pheochromocytomas and paragangliomas revealed by whole-genome array-CGH analysis. Endocr Relat Cancer, 2010.
Poplawski, A.B., Jankowski, M., Erickson, S.W., Diaz de Stahl, T., Partridge, E.C., Crasto, C., Guo, J., Gibson, J., Menzel, U., Bruder, C.E., Kaczmarczyk, A., Benetkiewicz, M., Andersson, R., Sandgren, J., Zegarska, B., Bala, D., Srutek, E., Allison, D.B., Piotrowski, A., Zegarski, W., and Dumanski, J.P., Frequent genetic differences between matched primary and metastatic breast cancer provide an approach to identification of biomarkers for disease progression. Eur J Hum Genet, 2010. 18(5): p. 560-8.
Enjin, A., Rabe, N., Nakanishi, S.T., Vallstedt, A., Gezelius, H., Memic, F., Lind, M., Hjalt, T., Tourtellotte, W.G., Bruder, C.E., Eichele, G., Whelan, P.J., and Kullander, K., Identification of novel spinal cholinergic genetic subtypes disclose Chodl and Pitx2 as markers for fast motor neurons and partition cells. Journal Comparative Neurology, 2010. 518 (12): p. 2284-2304.
Nord, H., Hartmann, C., Andersson, R., Menzel, U., Pfeifer, S., Piotrowski, A., Bogdan, A., Kloc, W., Sandgren, J., Olofsson, T., Hesselager, G., Blomquist, E., Komorowski, J., von Deimling, A., Bruder, C.E., Dumanski, J.P., and de Stahl, T.D., Characterization of novel and complex genomic aberrations in glioblastoma using a 32K BAC array. Neuro Oncol, 2009. 11(6): p. 803-18.
Wineinger, N.E., Kennedy, R.E., Erickson, S.W., Wojczynski, M.K., Bruder, C.E., and Tiwari, H.K., Statistical issues in the analysis of DNA Copy Number Variations. Int J Comput Biol Drug Des, 2008. 1(4): p. 368-95.
Piotrowski, A., Bruder, C.E., Andersson, R., de Stahl, T.D., Menzel, U., Sandgren, J., Poplawski, A., von Tell, D., Crasto, C., Bogdan, A., Bartoszewski, R., Bebok, Z., Krzyzanowski, M., Jankowski, Z., Partridge, E.C., Komorowski, J., and Dumanski, J.P., Somatic mosaicism for copy number variation in differentiated human tissues. Hum Mutat, 2008. 29(9): p. 1118-24.
Descartes, M., Franklin, J., de Stahl, T.D., Piotrowski, A., Bruder, C.E., Dumanski, J.P., Carroll, A.J., and Mikhail, F.M., Distal 22q11.2 microduplication encompassing the BCR gene. Am J Med Genet A, 2008. 146A(23): p. 3075-81.
de Stahl, T.D., Sandgren, J., Piotrowski, A., Nord, H., Andersson, R., Menzel, U., Bogdan, A., Thuresson, A.C., Poplawski, A., von Tell, D., Hansson, C.M., Elshafie, A.I., Elghazali, G., Imreh, S., Nordenskjold, M., Upadhyaya, M., Komorowski, J., Bruder, C.E., and Dumanski, J.P., Profiling of copy number variations (CNVs) in healthy individuals from three ethnic groups using a human genome 32 K BAC-clone-based array. Hum Mutat, 2008. 29(3): p. 398-408.
Bruder, C.E., Piotrowski, A., Gijsbers, A.A., Andersson, R., Erickson, S., de Stahl, T.D., Menzel, U., Sandgren, J., von Tell, D., Poplawski, A., Crowley, M., Crasto, C., Partridge, E.C., Tiwari, H., Allison, D.B., Komorowski, J., van Ommen, G.J., Boomsma, D.I., Pedersen, N.L., den Dunnen, J.T., Wirdefeldt, K., and Dumanski, J.P., Phenotypically concordant and discordant monozygotic twins display different DNA copy-number-variation profiles. Am J Hum Genet, 2008. 82(3): p. 763-71.
Ardesjo, B., Hansson, C.M., Bruder, C.E., Rorsman, F., Betterle, C., Dumanski, J.P., Kampe, O., and Ekwall, O., Autoantibodies to glutathione S-transferase theta 1 in patients with primary sclerosing cholangitis and other autoimmune diseases. J Autoimmun, 2008. 30(4): p. 273-82.
Andersson, R., Bruder, C.E., Piotrowski, A., Menzel, U., Nord, H., Sandgren, J., Hvidsten, T.R., Diaz de Stahl, T., Dumanski, J.P., and Komorowski, J., A segmental maximum a posteriori approach to genome-wide copy number profiling. Bioinformatics, 2008. 24(6): p. 751-8.
Mikhail, F.M., Sathienkijkanchai, A., Robin, N.H., Prucka, S., Biggerstaff, J.S., Komorowski, J., Andersson, R., Bruder, C.E., Piotrowski, A., de Stahl, T.D., Dumanski, J.P., and Carroll, A.J., Overlapping phenotype of Wolf-Hirschhorn and Beckwith-Wiedemann syndromes in a girl with der(4)t(4;11)(pter;pter). Am J Med Genet A, 2007. 143A(15): p. 1760-6.
Mikhail, F.M., Descartes, M., Piotrowski, A., Andersson, R., de Stahl, T.D., Komorowski, J., Bruder, C.E., Dumanski, J.P., and Carroll, A.J., A previously unrecognized microdeletion syndrome on chromosome 22 band q11.2 encompassing the BCR gene. Am J Med Genet A, 2007. 143A(18): p. 2178-84.
Erickson, R.P., de Stahl, T.D., Bruder, C.E., and Dumanski, J.P., A patient with 22q11.2 deletion and Opitz syndrome-like phenotype has the same deletion as velocardiofacial patients. Am J Med Genet A, 2007. 143A(24): p. 3302-8.
Mantripragada, K.K., Thuresson, A.C., Piotrowski, A., Diaz de Stahl, T., Menzel, U., Grigelionis, G., Ferner, R.E., Griffiths, S., Bolund, L., Mautner, V., Nordling, M., Legius, E., Vetrie, D., Dahl, N., Messiaen, L., Upadhyaya, M., Bruder, C.E., and Dumanski, J.P., Identification of novel deletion breakpoints bordered by segmental duplications in the NF1 locus using high resolution array-CGH. J Med Genet, 2006. 43(1): p. 28-38.
Bohlooly, Y.M., Olsson, B., Bruder, C.E., Linden, D., Sjogren, K., Bjursell, M., Egecioglu, E., Svensson, L., Brodin, P., Waterton, J.C., Isaksson, O.G., Sundler, F., Ahren, B., Ohlsson, C., Oscarsson, J., and Tornell, J., Growth hormone overexpression in the central nervous system results in hyperphagia-induced obesity associated with insulin resistance and dyslipidemia. Diabetes, 2005. 54(1): p. 51-62.
Trifunovic, A., Wredenberg, A., Falkenberg, M., Spelbrink, J.N., Rovio, A.T., Bruder, C.E., Bohlooly, Y.M., Gidlof, S., Oldfors, A., Wibom, R., Tornell, J., Jacobs, H.T., and Larsson, N.G., Premature ageing in mice expressing defective mitochondrial DNA polymerase. Nature, 2004. 429(6990): p. 417-23.
Lindmark, H., Rosengren, B., Hurt-Camejo, E., and Bruder, C.E., Gene expression profiling shows that macrophages derived from mouse embryonic stem cells is an improved in vitro model for studies of vascular disease. Exp Cell Res, 2004. 300(2): p. 335-44.
von Tell, D., Bruder, C.E., Anderson, L.V., Anvret, M., and Ahlberg, G., Refined mapping of the Welander distal myopathy region on chromosome 2p13 positions the new candidate region telomeric of the DYSF locus. Neurogenetics, 2003. 4(4): p. 173-7.
Szijan, I., Rochefort, D., Bruder, C., Surace, E., Machiavelli, G., Dalamon, V., Cotignola, J., Ferreiro, V., Campero, A., Basso, A., Dumanski, J.P., and Rouleau, G.A., NF2 tumor suppressor gene: a comprehensive and efficient detection of somatic mutations by denaturing HPLC and microarray-CGH. Neuromolecular Med, 2003. 3(1): p. 41-52.
Mantripragada, K.K., Buckley, P.G., Benetkiewicz, M., De Bustos, C., Hirvela, C., Jarbo, C., Bruder, C.E., Wensman, H., Mathiesen, T., Nyberg, G., Papi, L., Collins, V.P., Ichimura, K., Evans, G., and Dumanski, J.P., High-resolution profiling of an 11 Mb segment of human chromosome 22 in sporadic schwannoma using array-CGH. Int J Oncol, 2003. 22(3): p. 615-22.
Hansson, C.M., Ali, H., Bruder, C.E., Fransson, I., Kluge, S., Andersson, B., Roe, B.A., Menzel, U., and Dumanski, J.P., Strong conservation of the human NF2 locus based on sequence comparison in five species. Mamm Genome, 2003. 14(8): p. 526-36.
Buckley, P.G., Mantripragada, K.K., Benetkiewicz, M., Tapia-Paez, I., Diaz De Stahl, T., Rosenquist, M., Ali, H., Jarbo, C., De Bustos, C., Hirvela, C., Sinder Wilen, B., Fransson, I., Thyr, C., Johnsson, B.I., Bruder, C.E., Menzel, U., Hergersberg, M., Mandahl, N., Blennow, E., Wedell, A., Beare, D.M., Collins, J.E., Dunham, I., Albertson, D., Pinkel, D., Bastian, B.C., Faruqi, A.F., Lasken, R.S., Ichimura, K., Collins, V.P., and Dumanski, J.P., A full-coverage, high-resolution human chromosome 22 genomic microarray for clinical and research applications. Hum Mol Genet, 2002. 11(25): p. 3221-9.
Bruder, C.E., Hirvela, C., Tapia-Paez, I., Fransson, I., Segraves, R., Hamilton, G., Zhang, X.X., Evans, D.G., Wallace, A.J., Baser, M.E., Zucman-Rossi, J., Hergersberg, M., Boltshauser, E., Papi, L., Rouleau, G.A., Poptodorov, G., Jordanova, A., Rask-Andersen, H., Kluwe, L., Mautner, V., Sainio, M., Hung, G., Mathiesen, T., Moller, C., Pulst, S.M., Harder, H., Heiberg, A., Honda, M., Niimura, M., Sahlen, S., Blennow, E., Albertson, D.G., Pinkel, D., and Dumanski, J.P., High resolution deletion analysis of constitutional DNA from neurofibromatosis type 2 (NF2) patients using microarray-CGH. Hum Mol Genet, 2001. 10(3): p. 271-82.
Tapia-Paez, I., O'Brien, K.P., Kost-Alimova, M., Sahlen, S., Kedra, D., Bruder, C.E., Andersson, B., Roe, B.A., Hu, P., Imreh, S., Blennow, E., and Dumanski, J.P., Fine mapping of the constitutional translocation t(11;22)(q23;q11). Hum Genet, 2000. 106(5): p. 506-16.
Dunham, I., Shimizu, N., Roe, B.A., Chissoe, S., Hunt, A.R., Collins, J.E., Bruskiewich, R., Beare, D.M., Clamp, M., Smink, L.J., Ainscough, R., Almeida, J.P., Babbage, A., Bagguley, C., Bailey, J., Barlow, K., Bates, K.N., Beasley, O., Bird, C.P., Blakey, S., Bridgeman, A.M., Buck, D., Burgess, J., Burrill, W.D., Bruder, C.E., O'Brien, K.P., and et al., The DNA sequence of human chromosome 22. Nature, 1999. 402(6761): p. 489-95.
Bruder, C.E., Ichimura, K., Tingby, O., Hirakawa, K., Komatsuzaki, A., Tamura, A., Yuasa, Y., Collins, V.P., and Dumanski, J.P., A group of schwannomas with interstitial deletions on 22q located outside the NF2 locus shows no detectable mutations in the NF2 gene. Hum Genet, 1999. 104(5): p. 418-24.
Bruder, C.E., Ichimura, K., Blennow, E., Ikeuchi, T., Yamaguchi, T., Yuasa, Y., Collins, V.P., and Dumanski, J.P., Severe phenotype of neurofibromatosis type 2 in a patient with a 7.4-MB constitutional deletion on chromosome 22: possible localization of a neurofibromatosis type 2 modifier gene? Genes Chromosomes Cancer, 1999. 25(2): p. 184-90.
Bruder, C.E., Dumanski, J.P., and Kedra, D., The mouse ortholog of the human SMARCB1 gene encodes two splice forms. Biochem Biophys Res Commun, 1999. 257(3): p. 886-90.
Sulman, E.P., Dumanski, J.P., White, P.S., Zhao, H., Maris, J.M., Mathiesen, T., Bruder, C., Cnaan, A., and Brodeur, G.M., Identification of a consistent region of allelic loss on 1p32 in meningiomas: correlation with increased morbidity. Cancer Res, 1998. 58(15): p. 3226-30.
Carlson, K.M., Bruder, C., Nordenskjold, M., and Dumanski, J.P., 1p and 3p deletions in meningiomas without detectable aberrations of chromosome 22 identified by comparative genomic hybridization. Genes Chromosomes Cancer, 1997. 20(4): p. 419-24.
Fritid och intressen
Vatten!
Under min fritid vill jag vara på, i och under vatten! De flesta av mina fritidsintressen har klar koppling till vatten, även om det råkar vara fruset eller i form av snö.
Segling är det jag helst ägnar mig åt. Jag och en god vän hade en H-båt tillsammans innan jag flyttade till USA. Vi var ute så ofta vi hann, om än bara ut till närmsta ö i skärgården för en hastig grillmiddag och sedan hem igen. Jag är uppvuxen med båt och hoppas att en dag kunna segla över Atlanten. På bilden här bredvid seglar jag hobie på Mexikanska golfen. Livet är härligt!
Skidåkning är en annan av mina passioner. Jag sattes på skidor som fyraåring och lät som femåring mamma veta att jag åkte minst lika snabbt som Stenmark. Jag tävlade alpint fram till tonåren, även om vi i Jönköping mest tränade på barmark. Jag åk
er nu helst friåkning, gärna utanför pisten eller i puckelpist. Jag har både provat och dissat både snow board och telemark och hävdar att roligast har man på en bra carvingskida.
Allt måste dock inte gå fort...
Även om jag gillar fart och fläkt så måste inte allt gå så fort. Jag har ett antal projekt runt huset som går allt annat an snabbt. Jag har små odlingar runt huset, det växer spenat och sallad och jordgubbsminiatyrer i olika små byttor. I mina tankar ser jag hur dessa små krukor snart skall explodera och ge oss hemodlade bär och grönsaker för resten av året. Mer realistiskt
så kan det kanske bli ett par självodlade tomater innan hösten kommer... Jag märker dock hur hjärnan får semester från veckan som gått och trädgårdspyssel är som balsam för själen.
Jag är en social person och tycker mycket om att laga mat. Detta intresse delar jag med min hustru och vi försöker att bjuda på svensk mat och svenska traditioner här i den djupa amerikanska södern.
Under min fritid vill jag vara på, i och under vatten! De flesta av mina fritidsintressen har klar koppling till vatten, även om det råkar vara fruset eller i form av snö.
Segling är det jag helst ägnar mig åt. Jag och en god vän hade en H-båt tillsammans innan jag flyttade till USA. Vi var ute så ofta vi hann, om än bara ut till närmsta ö i skärgården för en hastig grillmiddag och sedan hem igen. Jag är uppvuxen med båt och hoppas att en dag kunna segla över Atlanten. På bilden här bredvid seglar jag hobie på Mexikanska golfen. Livet är härligt!
Skidåkning är en annan av mina passioner. Jag sattes på skidor som fyraåring och lät som femåring mamma veta att jag åkte minst lika snabbt som Stenmark. Jag tävlade alpint fram till tonåren, även om vi i Jönköping mest tränade på barmark. Jag åk
er nu helst friåkning, gärna utanför pisten eller i puckelpist. Jag har både provat och dissat både snow board och telemark och hävdar att roligast har man på en bra carvingskida.Allt måste dock inte gå fort...
Även om jag gillar fart och fläkt så måste inte allt gå så fort. Jag har ett antal projekt runt huset som går allt annat an snabbt. Jag har små odlingar runt huset, det växer spenat och sallad och jordgubbsminiatyrer i olika små byttor. I mina tankar ser jag hur dessa små krukor snart skall explodera och ge oss hemodlade bär och grönsaker för resten av året. Mer realistiskt
så kan det kanske bli ett par självodlade tomater innan hösten kommer... Jag märker dock hur hjärnan får semester från veckan som gått och trädgårdspyssel är som balsam för själen.Jag är en social person och tycker mycket om att laga mat. Detta intresse delar jag med min hustru och vi försöker att bjuda på svensk mat och svenska traditioner här i den djupa amerikanska södern.
Subscribe to:
Posts (Atom)
